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关于单细胞转录组测序(scRNA-seq)外送检测项目招标公告

所在地区: 浙江-台州-黄岩区 发布日期: 2025年9月26日
招标采购正文
关于单细胞转录组测序(scRNA-seq)外送检测项目招标公告2025-09-26 14:57阅读量:72作者:来源:

台州市第一人民医院

(单细胞转录组测序(scRNA-seq))委托外送检测

公开招标文件

项目编号:

20251014-01-JN

编制日期:

2025年9月 26日

招标公告

一、项目基本情况

台州市第一人民医院拟开展一项关于痛风病人的基础研究,送检12个病人血样,进行scRNA+scATAC监测,委托外送检测。

二、单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术参数要求:

1.单细胞转录组样本处理

(1)使用GEXSCOPE?组织解离液进行组织解离得到细胞悬液。

(2)使用Countstar荧光细胞计数仪结合显微镜对细胞悬液进行质检;采用荧光技术原理同时检测采购方样品的细胞悬液浓度、细胞活性、结团率,细胞直径分布,有无红细胞污染等重要指标,样本要满足建库要求。

2. 单细胞转录组文库构建

(1)具备Singleron Matrix NEO?文库构建系统,基于微流控微孔板技术原理完成细胞分离,使用GEXSCOPE? Single Cell RNA Library Kit 单细胞转录组试剂盒完成建库。

(3)采用安捷伦核酸片段分析仪(5300)对样本cDNA和构建好的文库进行文库质量检测,对符合标准的文库进行后续的上机测序。对符合合格标准(活性≥85%,细胞浓度≥1105/ml)的样本,目标捕获细胞数不低于7000/样本。

3. 单细胞转录组数据产出

(1)要求使用Illumina Novaseq测序平台进行测序,测序策略为PE150。

(2)测序质量要求:Q20>85%,Q30>80%,碱基类型分布均匀;采用严格的数据指控标准,保证数据质量。平均每个转录组文库测序数据量不低于100G。

4. 单细胞转录组结题报告展示

数据下机后,对测序数据进行质量评估,并出相应的质控结题报告来展示项目的有效数据量、测序质量、捕获细胞数、中值基因数等全面的数据产量及质量信息。

5.数据保存时限

在项目完结交付原始数据后,可保存原始数据30天。

6.售后服务团队安排及响应时间要求

投标方需为本项目配备足够的售后服务团队,在项目完结的6个月内,如采购方有需求,可向采购方提供免费的结题报告内的项目咨询以及技术支持服务。

投标方售后服务响应时间:电话响应时间要求6小时内,如遇电话无法解决的问题,可提供上门技术支持服务,到场响应时间要求3个工作日内。

单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq)技术参数要求:

1.单细胞染色质可及性测序样本处理

(1)新鲜样品保存及运输:能够提供组织保存液保存样品,血液样本用EDTA抗凝管采集,保存温度为2-8℃,保存时长达到72小时。

(2)新鲜样本单细胞悬液制备:使用温和的组织解离液对样品进行组织解离,获得高质量单细胞悬液。血液样本分离PBMC。

(3)单细胞核悬液制备:通过细胞核分离液,根据实际情况调整使用量,保证细胞核分离高效,浓度≥3105 Nucleus /mL,细胞核成团率低,染色后的细胞核明亮且不成团。

(4)在单细胞核悬液制备完成后,使用荧光染料对细胞核染色后,使用细胞计数仪及荧光显微镜对样本的单细胞核悬液进行质检,并且采用荧光技术原理同时检测样品的细胞核浓度,细胞核活性,成团率,细胞核直径分布,有无红细胞污染等重要指标以满足建库要求。

2.单细胞染色质可及性测序文库构建

使用Singleron Single Cell ATAC Library Reagent Kit建库试剂盒,利用Tn5转座酶特性,将含有测序接头的序列引入到转座区域。然后捕获转座后的产物,从而构建单细胞ATAC文库。

3.单细胞染色质可及性测序数据产出

对于质检合格的文库使用Illumina测序平台对单细胞ATAC文库进行高通量测序,测序策略采用PE150,测序数据量不少于80G/样本。

4.单细胞染色质可及性测序结题报告展示

数据下机后,对测序数据进行质量评估,并出相应的质控结题报告来展示项目的有效数据量、测序质量、捕获细胞数等全面的数据产量及质量信息。

5.数据保存时限

数据保存时限:在项目完结交付原始数据后,可保存原始数据30天。

6.售后服务团队安排及响应时间要求

投标方需为本项目配备足够的售后服务团队,在项目完结的6个月内,如采购方有需求,可向采购方提供免费的结题报告内的项目咨询以及技术支持服务。

投标方售后服务响应时间:电话响应时间要求6小时内,如遇电话无法解决的问题,可提供上门技术支持服务,到场响应时间要求3个工作日内。

三、标书要求:标书制作一正一付如下:

3.1正本需加盖投标单位红章,并有授权代表签字。投标文件副本为正本(确保正本已完成签字、盖章等所有文件编制工作)的复印件;如正本副本装订完成后仍有修改的,正本、副本同时修改,并在修改处签字、盖章。

3.2投标文件页码顺序如下:

1、封面;2、报价一览表(竞标单位自制);3、投标人营业执照、授权代表法人委托书(含身份证复印件)、本项目涉及的相关资质文件;4、投标技术参数响应情况;5、同类项目近一年的合同书(建议三份或以上);6、其它需说明的资料。

3.3投标文件封面标明:

1、招标编号:

2、项目内容:

3、投标单位全称:4、授权代表姓名\联系电话:

5、日期:

四、需准备现场PPT介绍,公司资质、同类项目开展情况、公司优势等。

五、潜在供应商有意向参与竞标,请予发送10月10 日前《报名表》填写后发至694901151@qq.com.。

六、本项目开标时间定于2025年10月14日上午8:10;

开标地点:台州市黄岩区横街路218号台州市第一人民医院1号楼竞标室。

七、评标方法:采用综合评标方,由招标小组成员综合评价,独立推选中标排序。

八、不明事宜,请联系项目负责人:包老师(0576-84016788)

按照客观、公正、公开的原则,本条信息受业主方委托独家指定在中国建设招标网 www.jszhaobiao.com 发布

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